我有一组基于DNA序列进行比对和聚类的基因,并且我以Newick树表示形式(https://en.wikipedia.org/wiki/Newick_format)拥有这组基因.有谁知道如何将该格式转换为scipy.cluster.hierarchy.linkage矩阵格式？从链接矩阵的scipy文档中：A (n-1) by 4 matrix Z is returned. At the i-th iteration, clusterswith indices Z[i, 0] and Z[i, 1] are combined to form cluster n+i. Acluster with an index less than n corresponds to one...
以下代码在每个运行时给出不同的结果,同时使用k均值方法将数据聚类为3个部分：from numpy import array from scipy.cluster.vq import kmeans,vqdata = array([1,1,1,1,1,1,3,3,3,3,3,3,7,7,7,7,7,7]) centroids = kmeans(data,3,100) #with 100 iterations print (centroids)获得的三个可能的结果是：(array([1, 3, 7]), 0.0) (array([3, 7, 1]), 0.0) (array([7, 3, 1]), 0.0)实际上,计算出的k均值的顺序是不同的.但是,分配哪个k...
一. redis集群模式有多种, cluster模式只是其中的一种实现方式, 其原理请自行谷歌或者百度, 这里只举例如何使用Python操作 redis cluster 集群 二. python 连接 redis cluster 集群第三方库:redis-py-cluster: 最近还在维护rediscluster: 似乎很久没有更新了pip install redis-py-clusterfrom rediscluster import StrictRedisCluster# redis cluster 集群最少三主三从 startup_nodes = [{"host":"192.168.3.25", "port":6379}, ...
建立了一个MongoDB集群，集群名称 replSet=rs0，包含以下 3 个节点：172.16.250.233:27017 # SECONDARY 172.16.250.234:27017 # PRIMARY 172.16.250.237:27017 # SECONDARY 集群的 test 用户的密码为 “123456” ，只能访问 test 数据库。 另外还有一个MongoDB数据库单独部署在 172.16.250.238，其 admin 用户的密码为 “123456” ，只能访问 admin 数据库。 MongoDB集群没有提供类似MySQL集群和Redis集群中的虚拟IP。在使用的时候...