我通常有大量的依赖作业,并且想要在PBS群集环境中有效地运行它们.我一直在使用Ruffus,对此非常满意,但是我还想尝试其他方法. 在python中看起来很有趣的是水罐.但是,似乎水罐假定作业在要求上是相同的.我有些工作需要8GB RAM,而另一些工作只需要100MB.有些可以消耗所有处理器,有些则是单线程的.我的目标是能够快速组装管道,运行管道并根据依赖关系对其进行“更新”,并合理记录日志,以便我可以看到仍然需要运行哪些作业.是否有人使用...
当使用sklearn类sklearn.cluster进行K-means聚类时,拟合的k-means对象具有3个属性,包括一个名为cluster_centers_的聚类中心(中心x特征)的numpy数组.但是,这些中心没有附加标签. 我的问题是：cluster_centers_中的中心(行)是否按标签值排序？也就是说,第1行是否对应于标记为1的群集的中心？还是将它们随机放置在阵列中？指向任何文档的指针将绰绰有余. 谢谢.解决方法:我找不到文档,但是是的,它是按集群排序的. 所以：kmeans.cluster...
部署信息：“ pyspark –master yarn-client –num-executors 16 –driver-memory 16g –executor-memory 2g” 我正在将一个100,000行文本文件(以hdfs dfs格式)转换为带有corpus = sc.textFile(“ my_file_name”)的RDD对象.当我执行corpus.count()时,我得到100000.我意识到所有这些步骤都是在主节点上执行的. 现在,我的问题是,当我执行诸如new_corpus = corpus.map(some_function)之类的操作时,pyspark会自动在所有可用的奴隶(在我...
参考:https://blog.csdn.net/zhangdongren/article/details/82685932 学校GPU集群为无网环境，所以要离线安装 1.下载python 源文件 2.解压到~下的某个目录---make编译源文件-----make install指定安装到哪------vim ~/.bash_profile 设置环境变量 。此时运行python3就OK了（） 3.安装pytorch
你能告诉我jupyter集群有什么用吗？我创建了jupyter集群,并建立了它的连接.但是我仍然很困惑,如何有效地使用这个集群？ 谢谢解决方法:使用Jupyter Notebook群集,您可以在本地计算机上运行笔记本,并通过设置适当的端口号连接到群集上的笔记本.示例代码： >使用ssh username @ ip_address到服务器转到服务器.>设置运行笔记本的端口号.在远程终端上运行jupyter notebook –no-browser –port = 7800>在本地终端上运行ssh -N -f -L loc...
根据我对DBSCAN的理解,您可以指定一个100米的ε,并且 – 因为DBSCAN在查找群集时会考虑密度可达性而不是直接的密度可达性 – 最终得到一个最大距离的群集在任何两点之间是> 100米在更极端的可能性中,似乎可以设置100米的epsilon并最终得到1公里的簇：see [2][6] in this array of images from scikit learn作为可能发生的时间的示例. (我非常愿意被告知我是一个完全白痴,并且误解了DBSCAN,如果这就是这里发生的事情.) 是否存在基于...
我有一个网络图数据,并希望根据节点之间的距离将节点分成簇.是否有任何python库或其他工具,我可以通过python脚本给出输入,并可以查询节点所属的集群.解决方法:scikit-learn包括各种clustering algorithms,包括一些接受距离矩阵作为输入. [免责声明：我参与了scikit-learn项目.]
我正在组装python语言中提供的不同可视化工具.我找到了Treemap. (http://pypi.python.org/pypi/treemap/1.05) 你能建议一些其他可用的工具吗？我正在探索Web数据可视化的不同方式.解决方法:如果您可以使用jython,那么Java有一些很好的可视化库,包括： > Prefuse> Piccolo 如果您在服务器上使用Python并且想要使用Javascript或Flash,则可以使用其他库 使用Javascript： > Javascript InfovisToolkit> Processing.js> Protovis 闪： ...
我有一个关于scipy的kmeans和kmeans2的问题.我有一组1700个lat-long数据点.我想在空间上将它们聚类成100个簇.但是,当使用kmeans vs kmeans2时,我得到了截然不同的结果.你能解释一下这是为什么吗？我的代码如下. 首先,我加载数据并绘制坐标.这看起来都很正确.import pandas as pd, numpy as np, matplotlib.pyplot as plt from scipy.cluster.vq import kmeans, kmeans2, whitendf = pd.read_csv('data.csv') df.head()coordinates ...
我试图在Spark HDInsight集群上运行python wordcount,我正在从Jupyter运行它.我不确定这是否是正确的方法,但我找不到任何有关如何在HDInsight Spark集群上提交独立python应用程序的帮助. 代码 ：import pyspark import operator from pyspark import SparkConf from pyspark import SparkContext import atexit from operator import add conf = SparkConf().setMaster("yarn-client").setAppName("WC") sc = SparkContext(conf = ...
希望这可以用python完成！我在相同的数据上使用了两个集群程序,现在有两个集群文件.我重新格式化了文件,使它们看起来像这样：Cluster 0: Brucellaceae(10)Brucella(10)abortus(1)canis(1)ceti(1)inopinata(1)melitensis(1)microti(1)neotomae(1)ovis(1)pinnipedialis(1)suis(1) Cluster 1:Streptomycetaceae(28)Streptomyces(28)achromogenes(1)albaduncus(1)anthocyanicus(1)etc.这些文件包含细菌种类信息.所以我有簇号(簇0),然后...
我有一个一维数值数据集(但我的问题也适用于一个n维数值数据集)我想要聚类,我已经知道了聚类中心的值.所以我只想将每个数据点映射到其关联的聚类中心(最接近数据点的聚类中心). 我可以编写一个ad hoc函数,但我真的更喜欢使用优化的Python科学库来处理pandas.Series或numpy.arrays,因为我的数据集非常大(数亿个数据点). 我怎样才能做到这一点？ 谢谢！解决方法:你正在寻找scipy vq function. 第一个参数是要聚类的数据,第二个参数是...
我有一个在bigquery中加载的数据表,我想通过pyspark .py文件在我的spark集群中导入它. 我在Dataproc + BigQuery examples – any available?中看到有一种方法可以使用scala在spark集群中加载一个bigquery表,但有没有办法在pyspark脚本中执行它？解决方法:这来自@MattJ在this question.这是一个连接到Spark中的BigQuery并执行字数统计的示例.import json import pyspark sc = pyspark.SparkContext()hadoopConf=sc._jsc.hadoopConfi...
Kafka初识 1、Kafka使用背景在我们大量使用分布式数据库、分布式计算集群的时候，是否会遇到这样的一些问题：我们想分析下用户行为（pageviews），以便我们设计出更好的广告位 我想对用户的搜索关键词进行统计，分析出当前的流行趋势 有些数据，存储数据库浪费，直接存储硬盘效率又低 这些场景都有一个共同点： 数据是由上游模块产生，上游模块，使用上游模块的数据计算、统计、分析，这个时候就可以使用消息系统，尤其是分布式消息...
galery.py文件内容import pexpect import os import configparserHOSTNAME_DB1=db1 HOSTNAME_DB2=db2 HOSTNAME_DB3=db3DB1 = 192.168.254.30 DB2 = 192.168.254.31 DB3 = 192.168.254.39 PORT = 22 USERNAME = root PASSWORD = root #DB1 config = configparser.ConfigParser() config.read("/etc/my.cnf.d/server.cnf", encoding="utf-8") config.set(galera,wsrep_on,ON) config.set(galera,wsrep_provider,/usr/lib64/galera...