python怎么实现canopy聚类

内容导读

互联网集市收集整理的这篇技术教程文章主要介绍了python怎么实现canopy聚类，小编现在分享给大家，供广大互联网技能从业者学习和参考。文章包含4053字，纯文字阅读大概需要6分钟。

内容图文

使用的包：

import math
import random
import numpy as np
from datetime import datetime
from pprint import pprint as p
import matplotlib.pyplot as plt

1.首先我在算法中预设了一个二维（为了方便后期画图呈现在二维平面上）数据dataset。

当然也可以使用高纬度的数据，并且我将canopy核心算法写入了类中，后期可以通过直接调用的方式对任何维度的数据进行处理，当然只是小批量的，大批量的数据可以移步Mahout和Hadoop了。

# 随机生成500个二维[0,1)平面点
dataset = np.random.rand(500, 2)

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2.然后生成个两类，类的属性如下：

class Canopy:
    def __init__(self, dataset):        
        self.dataset = dataset        
        self.t1 = 0
      self.t2 = 0

加入设定t1和t2初始值以及判断大小函数

   # 设置初始阈值  
def setThreshold(self, t1, t2):        
    if t1 > t2:
        self.t1 = t1            
        self.t2 = t2        
    else:
        print('t1 needs to be larger than t2!')

3.距离计算，各个中心点之间的距离计算方法我使用的欧式距离。

#使用欧式距离进行距离的计算
def euclideanDistance(self, vec1, vec2):        
    return math.sqrt(((vec1 - vec2)**2).sum())

4.再写个从dataset中根据dataset的长度随机选择下标的函数

# 根据当前dataset的长度随机选择一个下标 
def getRandIndex(self):        
    return random.randint(0, len(self.dataset) - 1)

5.核心算法

def clustering(self):        
        if self.t1 == 0:
            print('Please set the threshold.')        
        else:
            canopies = []  # 用于存放最终归类结果
            while len(self.dataset) != 0:
                rand_index = self.getRandIndex()
                current_center = self.dataset[rand_index]  # 随机获取一个中心点，定为P点
                current_center_list = []  # 初始化P点的canopy类容器
                delete_list = []  # 初始化P点的删除容器
                self.dataset = np.delete(                    
                     self.dataset, rand_index, 0)  # 删除随机选择的中心点P
                for datum_j in range(len(self.dataset)):
                    datum = self.dataset[datum_j]
                    distance = self.euclideanDistance(
                        current_center, datum)  # 计算选取的中心点P到每个点之间的距离
                    if distance < self.t1:
                        # 若距离小于t1，则将点归入P点的canopy类
                        current_center_list.append(datum)                    
                    if distance < self.t2:
                        delete_list.append(datum_j)  # 若小于t2则归入删除容器
                # 根据删除容器的下标，将元素从数据集中删除
                self.dataset = np.delete(self.dataset, delete_list, 0)
                canopies.append((current_center, current_center_list))        
          return canopies

为了方便后面的数据可视化，我这里的canopies定义的是一个数组，当然也可以使用dict。
6.main()函数

def main():
    t1 = 0.6
    t2 = 0.4
    gc = Canopy(dataset)
    gc.setThreshold(t1, t2)
    canopies = gc.clustering()
    print('Get %s initial centers.' % len(canopies))    
    #showCanopy(canopies, dataset, t1, t2)

Canopy聚类可视化代码

def showCanopy(canopies, dataset, t1, t2):
    fig = plt.figure()
    sc = fig.add_subplot(111)
    colors = ['brown', 'green', 'blue', 'y', 'r', 'tan', 'dodgerblue', 'deeppink', 'orangered', 'peru', 'blue', 'y', 'r',              'gold', 'dimgray', 'darkorange', 'peru', 'blue', 'y', 'r', 'cyan', 'tan', 'orchid', 'peru', 'blue', 'y', 'r', 'sienna']
    markers = ['*', 'h', 'H', '+', 'o', '1', '2', '3', ',', 'v', 'H', '+', '1', '2', '^',               '<', '>', '.', '4', 'H', '+', '1', '2', 's', 'p', 'x', 'D', 'd', '|', '_']    for i in range(len(canopies)):
        canopy = canopies[i]
        center = canopy[0]
        components = canopy[1]
        sc.plot(center[0], center[1], marker=markers[i],
                color=colors[i], markersize=10)
        t1_circle = plt.Circle(
            xy=(center[0], center[1]), radius=t1, color='dodgerblue', fill=False)
        t2_circle = plt.Circle(
            xy=(center[0], center[1]), radius=t2, color='skyblue', alpha=0.2)
        sc.add_artist(t1_circle)
        sc.add_artist(t2_circle)        for component in components:
            sc.plot(component[0], component[1],
                    marker=markers[i], color=colors[i], markersize=1.5)
    maxvalue = np.amax(dataset)
    minvalue = np.amin(dataset)
    plt.xlim(minvalue - t1, maxvalue + t1)
    plt.ylim(minvalue - t1, maxvalue + t1)
    plt.show()

效果图如下：

以上就是python怎么实现canopy聚类的详细内容。

内容总结

以上是互联网集市为您收集整理的python怎么实现canopy聚类全部内容，希望文章能够帮你解决python怎么实现canopy聚类所遇到的程序开发问题。 如果觉得互联网集市技术教程内容还不错，欢迎将互联网集市网站推荐给程序员好友。

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