Python：读取文本文件并将文件拆分为列表变量,每个变量各有4行

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内容图文

我有一个文本文件(fastq文件).
该文件的格式

1st line - ID
2nd Line - Sequence
3rd Line - something
4th Line - something else.

然后再次重复这4行.

例如：

1  @M9890393393
2 ATCTGTAAAA
3 +
4 FG%@ATAAAA
5  @M9890393394
6 ATGTCTATCC
7 +
8 AA%$$983089

我想做的是,分割此文件,以便可以按4行读取此文件.我可以制作一个列表,每个变量每个包含4行.在上面的示例中,我将列出带有2个变量的列表.

解决方法:

使用生成器,您可以定义一个惰性读取器,该读取器每次都会产生4个值的列表.

您可以如下所述耗尽或延迟迭代生成器.

import csv
from io import StringIO

mystr = StringIO("""1  @M9890393393
2 ATCTGTAAAA
3 +
4 FG%@ATAAAA
5  @M9890393394
6 ATGTCTATCC
7 +
8 AA%$$983089
""")

def gen():
    # replace mystr with open('file.csv', 'r')
    with mystr as fin:
        reader = csv.reader(fin, delimiter=' ',  skipinitialspace=True)
        res = []
        for line in reader:
            res.append(line[1])
            if len(res) == 4:
                yield res
                res = []

耗尽发电机：

lines = list(gen())

print(lines)

[['@M9890393393', 'ATCTGTAAAA', '+', 'FG%@ATAAAA'],
 ['@M9890393394', 'ATGTCTATCC', '+', 'AA%$$983089']]

迭代生成器：

for line in gen():
    print(line)

['@M9890393393', 'ATCTGTAAAA', '+', 'FG%@ATAAAA']
['@M9890393394', 'ATGTCTATCC', '+', 'AA%$$983089']

内容总结

以上是互联网集市为您收集整理的Python：读取文本文件并将文件拆分为列表变量,每个变量各有4行全部内容，希望文章能够帮你解决Python：读取文本文件并将文件拆分为列表变量,每个变量各有4行所遇到的程序开发问题。 如果觉得互联网集市技术教程内容还不错，欢迎将互联网集市网站推荐给程序员好友。

内容备注

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