可选参数Python？

内容导读

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内容图文

我需要创建一个名为extractGenes.py的程序

命令行参数需要采用2 OR 3参数：

> -s是一个可选参数或开关,表示用户wwants拼接的基因序列(内含子被删除).用户不必提供这个(意味着他想要整个基因序列),但是他确实提供了它,那么它必须是第一个参数
>输入文件(带基因)
>输出文件(程序将创建存储fasta文件的位置)

该文件包含这样的行：

NM_001003443 chr11 + 5925152 592608098 2 5925152,5925652, 5925404,5926898,

但是,我不知道如何在启动函数中包含-s可选参数.

所以我开始：

getGenes(-s, input, output):
fp = open(input, 'r')
wp = open(output, "w")

但我不确定如何包含-s.

解决方法:

这种情况很简单,直接使用sys.argv：

import sys

spliced = False
if '-s' in sys.argv:
    spliced = True
    sys.argv.remove('-s')
infile, outfile = sys.argv[1:]

或者,您也可以使用更强大的工具(如argparse和optparse)生成命令行解析器：

import argparse

parser = argparse.ArgumentParser(description='Tool for extracting genes')
parser.add_argument('infile', help='source file with the genes')
parser.add_argument('outfile', help='outfile file in a FASTA format')
parser.add_argument('-s', '--spliced', action='store_true', help='remove introns')

if __name__ == '__main__':
    result = parser.parse_args('-s myin myout'.split())
    print vars(result)

内容总结

以上是互联网集市为您收集整理的可选参数Python？全部内容，希望文章能够帮你解决可选参数Python？所遇到的程序开发问题。 如果觉得互联网集市技术教程内容还不错，欢迎将互联网集市网站推荐给程序员好友。

内容备注

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