python – 使用astropy.io读取一堆FITS时的OSError 24(打开的文件太多)
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我正在尝试使用astropy.io.fits将几千个FITS加载到内存中:
def readfits(filename):
with fits.open(filename) as ft:
# the fits contain a single HDU
data = ft[0].data
return data
data_sci = []
for i in range(2000):
data_sci.append(readfits("filename_{}.fits".format(i)))
但是,当到达第1015个文件时,OSError:[Errno 24]打开太多
文件被引发.
我有同样的问题:
def readfits(filename):
ft = fits.open(filename) as ft:
data = ft[0].data
ft.close()
return data
我怀疑astropy.io.fits没有正确关闭文件.有没有
我可以强制关闭文件的方式?
解决方法:
您的readfits函数实际上保持文件句柄处于打开状态以便保持对数据的访问,因为默认情况下它会为数据创建一个mmap并且不会将其完全读入物理内存,如下所述:http://astropy.readthedocs.org/en/latest/io/fits/appendix/faq.html#i-m-opening-many-fits-files-in-a-loop-and-getting-oserror-too-many-open-files
顺便提一下,如果你只想要一个从第一个HDU中读取数据的函数,那么它已经内置于:http://docs.astropy.org/en/v1.0.5/io/fits/api/files.html#astropy.io.fits.getdata
没有必要重新发明轮子.
内容总结
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