python-SQLAlchemy-简单的选择语句

内容导读

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内容图文

背景：

我是SQLAlchemy的新手,对于应该如何选择事物似乎有些困惑.

我的mysql数据库中有一个名为genes的表,其中有gene_id,gene_description和gene_symbol

我想做的事：

我要做的只是一个简单的选择查询：

Select * from Genes

但是我似乎对如何实现这一目标感到困惑

这是我所做的：

import sqlalchemy
from sqlalchemy.orm import sessionmaker
from sqlalchemy.ext.automap import automap_base
import csv
import pandas as pd

engine = sqlalchemy.create_engine('mysql://root:toor@localhost') # connect to server
metadata = sqlalchemy.MetaData(bind=engine)
engine.execute("USE TestDB")

genes = sqlalchemy.table('Genes')
s = sqlalchemy.select([genes])
engine.execute(s)

问题：

ProgrammingError: (_mysql_exceptions.ProgrammingError) (1064, "You have an error in your SQL syntax; check the manual that corresponds to your MySQL server version for the right syntax to use near 'FROM `Genes`' at line 2") [SQL: u'SELECT  \nFROM `Genes`']

也有某种类型的“智能”,我可以像gene_table = engine.Gene一样做.如果我没记错的话,可以通过映射来做到这一点,但是这对我没有用

编辑：
这可能会有所帮助：

How to automatically reflect database to sqlalchemy declarative?

解决方法:

因此,我们可以使用反射,而不必显式创建类,但是如果我们想提高速度,可以使用如下所示的sqlautocode来创建它们：

Reverse engineer SQLAlchemy declarative class definition from existing MySQL database?

mysql数据库也存在问题,它将给出如下错误：(取自bitbucket：https://bitbucket.org/zzzeek/sqlalchemy/issues/1909/reflection-issue-with-mysql-url-with-no)

SNIP...
File "/opt/buildout-eggs/SQLAlchemy-0.6.4-py2.5.egg/sqlalchemy/schema.py", line 1927, in __init__
    self.reflect()
  File "/opt/buildout-eggs/SQLAlchemy-0.6.4-py2.5.egg/sqlalchemy/schema.py", line 2037, in reflect
    connection=conn))
  File "/opt/buildout-eggs/SQLAlchemy-0.6.4-py2.5.egg/sqlalchemy/engine/base.py", line 1852, in table_names
    return self.dialect.get_table_names(conn, schema)
  File "<string>", line 1, in <lambda>
  File "/opt/buildout-eggs/SQLAlchemy-0.6.4-py2.5.egg/sqlalchemy/engine/reflection.py", line 32, in cache
    return fn(self, con, *args, **kw)
  File "/opt/buildout-eggs/SQLAlchemy-0.6.4-py2.5.egg/sqlalchemy/dialects/mysql/base.py", line 1791, in get_table_names
    self.identifier_preparer.quote_identifier(current_schema))
  File "/opt/buildout-eggs/SQLAlchemy-0.6.4-py2.5.egg/sqlalchemy/sql/compiler.py", line 1517, in quote_identifier
    return self.initial_quote + self._escape_identifier(value) + self.final_quote
  File "/opt/buildout-eggs/SQLAlchemy-0.6.4-py2.5.egg/sqlalchemy/dialects/mysql/mysqldb.py", line 77, in _escape_identifier
    value = value.replace(self.escape_quote, self.escape_to_quote)
AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'replace'

通过添加数据库名称(您正在使用的名称)来解决此问题,如下所示：

engine = create_engine('mysql+mysqldb://USER_NAME:PASSWORD@127.0.0.1/DATABASE_NAME', pool_recycle=3600) # connect to server

我用它来正确连接：
http://docs.sqlalchemy.org/en/latest/orm/extensions/automap.html
和这个：
http://docs.sqlalchemy.org/en/latest/core/engines.html

这也可能会有所帮助：
How to automatically reflect database to sqlalchemy declarative?

我的代码终于看起来像这样：

from sqlalchemy.ext.automap import automap_base
from sqlalchemy.orm import Session
from sqlalchemy import create_engine

Base = automap_base()

# engine, suppose it has two tables 'user' and 'address' set up
engine = create_engine('mysql+mysqldb://root:toor@127.0.0.1/TestDB', pool_recycle=3600) # connect to server

# reflect the tables
Base.prepare(engine, reflect=True)

# mapped classes are now created with names by default
# matching that of the table name.
Genes = Base.classes.Genes

Address = Base.classes.address
#Start Session
session = Session(engine)
#add a row:
session.add(Genes(Gene_Id=1,Gene_Symbol = "GENE_SYMBOL", Gene_Description="GENE_DESCRIPTION"))
session.commit()
q = session.query(Genes).all()
for gene in q:
    print "This is the Gene ID {},\n This is the Gene Desc {},\n this is the Gene symbol {}.".format(gene.Gene_Id,gene.Gene_Description, gene.Gene_Symbol )

内容总结

以上是互联网集市为您收集整理的python-SQLAlchemy-简单的选择语句全部内容，希望文章能够帮你解决python-SQLAlchemy-简单的选择语句所遇到的程序开发问题。 如果觉得互联网集市技术教程内容还不错，欢迎将互联网集市网站推荐给程序员好友。

内容备注

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